Peptid bağları

peptit bağının yapısı

Peptid bağları (-CO-NH-) doğada var olan en önemli bağlardan bazılarıdır. Karbon, oksijen, nitrojen ve hidrojen atomlarından oluşurlar. Bu bağlar, karboksil grubu (-COOH) ile amino grubu ( _-NH2 ) arasındaki yoğunlaşma reaksiyonuyla oluşturulur . Reaksiyon, çoğunlukla iki farklı veya özdeş amino asit arasında gerçekleşir. Yan ürünü su molekülüdür. Bir peptit bağı, hidrolizin bir sonucu olarak ayrışır . Daha sonra bölünür ve farklı amino asitler yeniden oluşturulur. Hidroliz, yüksek sıcaklıkta, su ortamında ve ayrıca konsantre inorganik asitlerin veya konsantre bazların varlığında gerçekleşir. Peptit bağları düzdür ve karbonil karbon ile nitrojen atomu arasında dönemezler. Bununla birlikte, bu tür bağlar mezomerik karaktere sahiptir, yani peptik bağdaki bir çift bağın "hareketinin" sonucu olan iki mezomerik form vardır. Sonuç olarak, karbon-azot bağı kısmen, kimyasal stabilitesini geliştiren bir çift bağın özelliklerini gösterir. Peptit bağları iki izomerik formda bulunur: cis ve trans (proteinler ve peptitlerdeki peptit bağı çoğunlukla trans’tır ).

polipeptitler

Kaç tane amino asit molekülünün peptit bağları yoluyla birbirine bağlandığına bağlı olarak şunları ayırt edebiliriz:

• iki amino asit molekülünden oluşan dipeptitler,
• Üç amino asit molekülünün bir kombinasyonu olan tripeptitler,
• 10’dan az amino asit kalıntısı içeren oligopeptitler,
• 10 ila 100 amino asit içeren polipeptitler ve
• 100’den fazla amino asit molekülü içeren yüksek moleküler yapılar olan proteinler.

İkiden fazla amino asit molekülünün kombinasyonu, polipeptitlerin oluşumuna yol açar. İki amino asit molekülü bir araya gelerek bir peptit bağı oluşturur. Bir kez birleştirildiğinde, amino asitler, diğer amino asit molekülleri ile daha fazla bağ oluşturabilen serbest fonksiyonel gruplara sahiptir. Polipeptitler bu şekilde oluşur.

Biüret reaksiyonunda peptit bağlarının saptanması

Biüret reaksiyonu , peptit bağlarının varlığını işaret eden karakteristik bir reaksiyondur. Ancak sadece peptit bağlarını tespit etmek için değil, miktar olarak belirlemek için de kullanılabilir. Bu, peptit bağlarının birbirine yakın olduğu kimyasal bileşikler için özellikle yararlıdır. Bu tür bileşikler peptitleri veya proteinleri içerir. Bir biüret reaksiyonunda en az iki peptit bağı tespit etmek mümkündür. Bu, bu yöntemi amino asitleri (peptit bağı olmayan) veya dipeptitleri (yalnızca bir peptit bağı olan) tespit etmek için uygunsuz hale getirir. Bir peptit bağını tespit etmek için, önce güçlü bir baz çözeltisi ( sodyum hidroksit veya potasyum hidroksit olabilir) ekleyerek temel bir reaksiyon ortamı oluşturmalıyız . Bu, renkli bir bakır (III) iyonları kompleksi oluşturmayı mümkün kılar. Daha sonra test edilen çözelti, yoğun mavi renkli bakır(III) sülfat ve potasyum sodyum tartrat (tüm kompleksin yeterli çözünürlüğünü koruyan) ile tamamlanır. Bakır(III) iyonları ile peptit bağları, 546 nm dalga boyu (maksimum absorpsiyon) ile spektrofotometrik olarak analiz edilebilen renkli bir kompleks oluşturur . Renk maviden menekşe rengine dönerse, test edilen malzemenin peptit bağı içerdiğini gösterir. Renk yoğunluğu peptit bağlarının miktarına bağlıdır.

Amino asitler, peptitler ve proteinler

Amino asitler, peptitler ve proteinlerin ortak bir paydası vardır, o da peptit bağıdır . Yukarıda bahsedilen tüm yapılar, doğa dünyasında ve vücudumuzun düzgün işleyişinde çok önemli bir rol oynamaktadır. Amino asitler , nispeten karmaşık moleküler yapıya sahip bileşiklerdir. Kimyasal açıdan en az bir amino grubu ve karboksil grubu içeren organik bileşiklerdir. Yanal zincirleri doğrusal, dairesel veya dallanmış olabilir. Amino asit molekülleri, çeşitli zincir uzunluklarına ve çeşitli bileşimlere sahip dimerler ve polimerler oluşturmak için birbirine bağlanır. Peptitler , yaklaşık 50 (en fazla 100) amino asit içeren yapılardır, bu nedenle genellikle kısa zincirli proteinler olarak adlandırılırlar. Düzenleyici ve verici olarak hareket ederek tüm fizyolojik süreçlerde yer alırlar. Bir karboksil grubu ile bir amino grubu arasında yoğunlaşma, yani bir peptit bağı oluşumu ile üretilirler. Bu reaksiyonun yan ürünü bir su molekülüdür. Proteinler , karmaşık bir tasarıma sahip yüksek moleküler moleküllerdir. Çeşitli dizilerde peptit bağları yoluyla birbirine bağlanan bir dizi amino asit içerirler. Amino asitler, bir amino asidin karboksil grubu başka bir amino asidin amino grubuyla veya aynı amino asidin başka bir molekülünün amino grubuyla bağlanacak şekilde proteinleri oluşturmak için birleşir; bu, serbest bir amino grubuna ve karboksil grubuna sahip olan sözde dipeptidi yaratır. Bu, daha fazla amino asit molekülü eklemeyi ve polipeptitler oluşturmayı mümkün kılar.